المسجد يعد من أهم المزارات لمحبى آل البيت فى مصر، إلا أن قليلين من يعرفون أن سيدنا على زين العابدين لم يدفن فى مصر، بل في البقيع، أما الضريح الموجود بمسجده فهو لنجله سيدنا زيد..
يقول المؤرخ أبو الحسن السخاوي في كتابه تحفة الأحباب وبغية الطلاب في الخطط والمزارات والتراجم والبقاع المباركات ، إن السيدة عائشة النبوية مدفونة في مصر وأنه عاين قبرها في تربة قديمة..