جاءت رسامة البابا متاؤس الثاني بطريركًا عام 1445م بعد نياحة البابا يوأنس الحادي عشر، إذ وقع الاختيار على أحد رهبان الدير المحرق المعروف بتقواه وبساطته
وتنيح البابا متاؤس الثاني البطريرك التسعون من بطاركة الكرازة المرقسية سنة 1182 للشهداء (1465م)، وهو تزامنا مع احتفالات الكنيسة.